随后，郑成功率军攻克舟山倭寇巢穴，搜出掠夺的财物、百姓，尽数归还沿海州县，安抚受难百姓，焚毁倭寇战船，拆除据点，又率军巡守外海，遭遇日本幕府援军，当即下令猛攻，一举击溃日本水师，斩杀其主将，焚毁战船无数。

日本幕府得知大军惨败，惊恐万分，深知大明水师实力强悍，再不敢滋生进犯之心，连忙派遣使者，携带降书贡品，乘船赶赴大明京城，向朱慈炯请罪，俯首称臣，立誓永不侵犯大明海疆，每年遣使朝贡，互通商贸。

三、西士入京朝野纷争

就在郑成功平定倭患，海疆安定的消息传至京城之际，另一桩奇事轰动了整个紫禁城。数名金发碧眼、身着异服的西洋传教士，历经万里波涛，远渡重洋，自广州登陆，一路北上，抵达京城，为首者乃是意大利传教士汤若望。

这些西洋传教士，并非只为传教而来，还带来了诸多中原从未有过的奇技淫巧与异域学问：精巧的自鸣钟、能望远的千里镜、西洋枪图谱、天文历法之书、几何算数之法，还有各类西洋药材、器械，令京城百姓与文武百官啧啧称奇。

汤若望等人抵达京城后，恳请面见大明皇帝，献上西洋奇物与天文历法、火器制造等典籍，愿留在大明，传授西洋学问，传播天主教义。

朱慈炯听闻此事，心生好奇，当即传旨，召见西洋传教士。金銮殿上，汤若望等人行大明君臣之礼，献上贡品，又现场演示千里镜、自鸣钟，讲解西洋天文历法、算数几何，阐述火器制造之术。

朱慈炯观罢，龙颜大悦，深感西洋诸多技艺、学问，确有可取之处，尤其西洋历法更为精准，火器制造之法亦能补强大明军备，有心接纳这些西洋学问，造福大明。

可朝堂之上，却因此掀起轩然大波。以翰林院一众老臣为首，纷纷站出反对，为首的大学士奏道：“陛下，西洋之人乃化外蛮夷，其学为旁门左道、奇技淫巧，违背我孔孟圣道，扰乱我大明礼法，万万不可接纳！若容其传教讲学，必乱我民心，坏我朝纲，恳请陛下将这些西洋人驱逐出境，焚毁其异域典籍，以正视听！”

而孙兰、诸葛牛等开明大臣，却持相反意见，孙兰出班启奏：“陛下，臣以为不然。我大明向来兼容并蓄，海纳百川，西洋历法、火器、算数之学，确有实用之处，能助我大明修订历法、精进军备、发展民生，大可取其精华，为我所用。至于其传教之事，只需加以管束，不使其扰乱民心即可，不必一概排斥。”

朝堂之上，两方大臣争论不休，各执一词，互不相让，朱慈炯端坐龙椅，细细思量，一时难以决断。

四、圣君定策兼容并蓄

退朝之后，朱慈炯召孙兰、诸葛牛、史可法等重臣入宫，共议西学之事。朱慈炯言道：“如今西洋学问传入中原，朝臣各执一词，众卿以为，该如何处置？”

孙兰率先进言：“陛下，我大明如今国力强盛，万邦来朝，理当有包容万物的气度。西洋之学，于天文、历法、军械、算数、医术皆有独到之处，若能吸纳学习，可补我大明之不足，助力国势更盛。若一味排斥，闭门造车，反倒不利于大明长远发展。只需定下规矩，管束西洋传教士，只许其传授技艺学问，不许干预朝政、蛊惑百姓，便可趋利避害。”